Geber86 / Getty Images
Tärkeimmät takeaways
- Los Angelesin lastensairaala teki tähän mennessä suurimman lasten genomisen COVID-19-tutkimuksen.
- Tutkimus kertoo mahdollisesta yhteydestä tiettyjen SARS-CoV-2-mutaatioiden ja taudin vakavuuden välillä.
- Näytteet osoittivat korkeaa geneettisen vaihtelun tasoa Kaliforniassa.
Kuten monet virukset, SARS-CoV-2, virus, joka aiheuttaa COVID-19: n, läpikäy monia geneettisiä mutaatioita, kun se leviää suurelle populaatiolle. Tutkijat ovat vasta alkaneet ymmärtää näitä vaihteluita ja niiden vaikutusta terveystuloksiin, erityisesti lasten kohdalla.
Tähän mennessä suurimmassa lasten genomisessa COVID-19 -tutkimuksessa Los Angelesin lastensairaalan ryhmä löysi yhteyden viruksen mutaatioiden ja taudin vakavuuden välillä. Marraskuun tutkimus julkaistiin lehdessäAvoin foorumi Tartuntataudit.
"Jos voimme tehdä mitään saadaksemme selville, onko viruksen genomimutaation genetiikan ja taudifenotyypin välillä korrelaatiota (COVID-19: n havaittavat ominaisuudet), sinulle voidaan kertoa, miten potilasta hoidetaan parhaiten", Xiaowu Gai PhD, yksi tutkimuksen tekijöistä ja bioinformatiikan johtaja Los Angelesin lastensairaalasta, kertoo Verywellille.
Ymmärtääkseen paremmin, miten geneettinen vaihtelu voi vaikuttaa lapsipopulaatioon, tutkimusryhmä analysoi viruksen geneettisen tiedon 141 tartunnan saaneelta lapselta 13. maaliskuuta - 16. kesäkuuta. Nämä näytteet osoittivat suurta vaihtelua ja yleisen yleisyyden esiintyvyyttä. mutaatio, joka liittyy suurempiin siirtonopeuksiin.
Mitä tämä tarkoittaa sinulle
COVID-19: n aiheuttavan viruksen SARS-CoV-2: n geneettinen materiaali kehittyy jatkuvasti. Tutkijat pyrkivät ymmärtämään, miten geneettiset mutaatiot voivat vaikuttaa tartunnan saaneiden potilaiden viruksen leviämiseen ja taudin vakavuuteen.
Aina muuttuva virus
Mutaatiot ovat virheitä, joita esiintyy viruksen genomissa - tai geneettisessä materiaalissa -, kun se replikoituu. Useimmilla viruksilla on jonkin verran vaihtelua, kun ne levittävät populaatiota. SARS-CoV-2: ssa monet mutaatioista ovat merkityksettömiä tai voivat jopa heikentää virusta. Toiset voivat kuitenkin vaikuttaa siihen, kuinka helposti virus tarttuu ja jopa kuinka vakava sairaus on.
"Kun monet ihmiset ajattelevat COVID-19: ää, he ajattelevat tätä yhtä asiaa, tätä singulariteettia", Gai sanoo. "Mutta se ei ole tapa, jolla katsomme sitä. Virus jokaisen potilaan kehossa, jossa on virusinfektio, on sekoitus monia erilaisia kopioita viruksesta. "
Yksi yleinen mutaatio, nimeltään D614G, aiheuttaa muutoksia viruksen piikkiproteiinissa.Vaikka se ei ollut yleistä, kun virus alkoi levitä maailmanlaajuisesti aiemmin tänä vuonna, versiosta on sittemmin tullut hallitseva maailmanlaajuisesti. Kirjoittajat ilmoittavat, että sitä oli läsnä 99,3 prosentissa kerätyistä lasten näytteistä.
D614G-mutaatio, joka lisää viruksen käyttämää piikkiproteiinia pääsyn pääsyyn ihmissoluihin, sallii viruksen siirtymisen helpommin. Ei ole vielä mitään vakuuttavaa näyttöä siitä, että tämä mutaatio muuttaa taudin oireiden vakavuutta.
COVID-19-piikkiproteiini välittää koronaviruksen pääsyn isäntäsoluun.
Tutkimusryhmä löysi kuitenkin yhteyden kladin 20C - viruksen mutatoidun version - ja vakavampien oireiden välillä. Kladit 20A, 20B ja 20C ovat kaikki äskettäin mutatoituja viruksen versioita. Kaikki tämän tutkimuksen vakavat pediatriset tapaukset ja kaikki kohtalaisen vakavia tapauksia lukuun ottamatta sisälsivät viruksen version, jossa oli kladia 20C.
Mutaatioiden vaikutukset
"Kun yleisö tarkastelee tällaista lausuntoa, kuulostaa pelottavalta, että virus on mutaatio", Stuart Campbell Ray, MD, tartuntatautien asiantuntija ja lääketieteen professori Johns Hopkinsin yliopistossa, kertoo Verywellille. "Mutta kaikilla RNA-viruksilla on mutaatioaste. Ja SARS-CoV-2: n mutaatioaste on noin viisi kertaa hitaampi kuin influenssa - ainakin se on ollut tähän mennessä. "
Tämä suhteellisen hidas mutaatioaste voi olla hyödyllistä tutkijoille, jotka yrittävät saada käsityksen uudesta viruksesta. Ray varoittaa kuitenkin, että tartunnan saaneiden ihmisten väestön kasvaessa kasvaa myös mutaatioiden nopeus.
Kun immuunijärjestelmää tuetaan ratkaisuilla virusinfektiota vastaan - kuten rokotus, aikaisempi altistuminen virukselle, toipuva plasma ja vasta-aineterapia - SARS-CoV-2 voi kehittyä immuunivasteiden välttämiseksi. Tämä tarkoittaa, että on mahdollista, että tällä hetkellä lupaavat rokotekandidaatit voivat heikentyä tulevina kuukausina viruksen mutaation jatkuessa.
"On olemassa riski - koska tämä pandemia ei ole hallinnassa - että nämä mutaatiot voivat kerääntyä ja voi tapahtua juuri oikeita, jotka voivat välttää immuunivasteita", Ray sanoo, joka ei ole sidoksissa tutkimukseen.
Rokotteet, jotka ovat osoittautuneet tehokkaiksi, suojaavat silti todennäköisesti kehoa virukselta. Mutta kuten muidenkin laajalle levinneiden virusten, kuten influenssan, kohdalla, rokotteen täydentäviä tai uusia versioita voidaan tarvita kattamaan kaikki uudet viruskannat, jotka tulevat esiin tulevaisuudessa.
Tuntemattomien muuttujien käsittely
Vaikka COVID-19: n ilmoitetaan usein olevan vähemmän vakava lapsille kuin aikuisille, joka kolmas sairauden vuoksi sairaalaan sairaalaan joutunut lapsi saapuu ICU: han tutkimuksen mukaan. Gai sanoo, että potilaille, joilla on vakava sairaus. tauti, viruksen geneettisen koostumuksen ymmärtäminen voi tarjota avainkäsityksen hoidon kehittämiseen.
Silti viruksen meikki voi kertoa geneettikoille vain niin paljon siitä, miten se vaikuttaa tartunnan saaneisiin ihmisiin. Heidän on myös otettava huomioon tartunnan saaneiden henkilöiden väestötiedot ja geneettiset tiedot.
Gai varoittaa, että vaikka nämä havainnot voivat viitata korrelaatioon tiettyjen mutaatioiden ja niiden tulosten välillä, tarvitaan kuitenkin vielä suurempia tutkimuksia osoittamaan, että mutaatio aiheuttaa ehdottomasti vakavamman sairauden. Siitä huolimatta, että se oli tähän mennessä suurin genominen lasten COVID-19 -tutkimus, siihen osallistui vain 141 lasta.
"Se ei ole oikeastaan kovin suuri otoskoko", Gai sanoo. "Emme voi tehdä korrelaatioanalyysiä jokaiselle yksittäiselle mutaatiolle sairausfenotyypin kanssa."
Lisäksi tutkimuksessa ei otettu huomioon iän, sukupuolen, olemassa olevien olosuhteiden ja muiden tärkeiden tekijöiden eroja. Potilaiden viruskuormitukseen liittyvät havainnot voivat myös olla vinoja sen perusteella, milloin näytteet kerättiin potilailta. Silti tutkimus auttaa kasvamaan tietoa siitä, miten geneettinen vaihtelu voi muokata tärkeitä terveystuloksia.
"Tarvitsemme tällaisia raportteja saadaksemme käsityksen viruksen kehittymisestä", Ray sanoo. "Tällaisten tutkimusten sekvensseillä, kun ne yhdistetään sekvensseihin kaikkialta maailmasta, on suuri arvo auttaa meitä ymmärtämään, miten tämä virus kehittyy ja onko meidän mukautettava strategioitamme sen hallitsemiseksi."